与华中农大合作又一成果病原菌致病因子查

贺｜喜

恒创基因与华中农大合作又一成果

文章发表单位：华中农业大学影响因子：5.4

猪链球菌ST1及ST7在中国人病例中的优势地位，以及发现新序列型ST

PredominanceofStreptococcussuisST1andST7inhumancasesinChina,anddetectionofanovelsequencetype,ST

猪链球菌是一种主要感染猪的动物传染病原细菌，目前已被发现也属于人类的致病菌。截止年最后一次感染人类的疫情爆发，近十年该菌的遗传多样性以及地理分布信息有待更新。中国已发现3种感染人类的菌株型（ST1，ST7及ST），本文对76株临床菌，运用MLST分类方法发现序列型主要归类为ST1及ST7，并另外发现一株新序列型ST。通过菌株LSM（ST）全基因组测序结合已知的26个猪链球菌完成图参考序列，进行比较基因组分析，发现ST7中存在89Kb致病岛(89K-PAI)，可通过水平基因转移到ST(73K-PAI)。基于物种进化分析，显示ST7，ST及ST1亲缘关系最近，ST可能起源于ST1，并且菌株可在不同国家之间传播。

材料选取：搜集-年之间的76株临床菌，已有26株完成图序列

研究方法：

1、通过MLST分析，发现在76株菌中，主要为序列型ST1(n=32,42.1%)andST7(n=43,56.6%)。

2、通过全基因测序分析，获得菌株LSM（ST）的基因组完成图，基因组大小为2,,bp,GC含量41.23%，发现15个与免疫逃逸及系统感染相关的毒力因子，并具有1个四环素抗性基因(tetM)。

3、通过毒理实验研究，发现LSM（ST）毒性很强，毒力高于国际参考菌株P1/7。

4、通过比较基因组分析，发现ST7菌株都存在89Kb致病岛(89K-PAI)，而ST则存在73kb的PAI，在传播过程（水平基因转移）中产生了序列多样性缺失3个gap。

5、通过基于27株菌的个核心基因（coregenes）的63,个SNPs构建系统发育树，发现ST7，ST及ST1一并聚类到枝系B，并且来源于中国及加拿大的菌株可以聚类到一起属于同一起源。

图A.26株菌的基因组比较图

图B.LSM菌株中73Kb致病岛的基因结构图

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